La charte Natura 2000 est un document contractuel qui permet à un propriétaire de s'engager dans une démarche de préservation d'habitat et/ou d'espèces d'intérêt communautaire, sur la base d'un cahier des charges de bonnes pratiques, dont les actions ne sont pas finançables. Une défiscalisation de(s) la parcelle(s) engagée(s) est toutefois possible.
Aucune charte n'est actuellement opérationnelle sur le bassin du Drugeon.