Le Syndicat Mixte des Milieux Aquatiques du Haut-Doubs (SMMAHD) a disparu au 31 décembre 2018 pour laisser place au 1er janvier 2019 à un nouveau syndicat : le Syndicat Mixte Haut-Doubs Haute-Loue (SMHDHL).
Le territoire s'est agrandi et couvre 9 communautés de commune, ainsi que le Département du Doubs :
- Lacs et Montagnes du Haut-Doubs
- Plateau de Frasne et Val du Drugeon
- Grand Pontarlier
- Montbenoît
- Loue Lison
- Altitude 800
- Val de Morteau
- Arbois Poligny Salins, Coeur du Jura
- Portes du Haut-Doubs
Ce nouveau syndicat a été créé suite à la loi GEMAPI sur la Gestion des Milieux Aquatiques et Prévention des Inondations