Le site présente 34 habitats différents recensés dont 12 d’intérêt communautaire. Cette diversité est liée aux différences de géologie, d’hydrologie, de topographie et d’usages rencontrées sur le site.
Les habitats d’intérêt communautaire couvrent 59% de la surface totale du site. Les végétations herbacées contribuent majoritairement à ce pourcentage.
Les zones humides, notamment localisées autour du lac de Malpas, présentent notamment un intérêt patrimonial exceptionnel avec l’existence de groupements végétaux relictuelles en France.
Ces différents habitats mis en évidence par trois ZNIEFF de type 1 et une ZNIEFF de type 2, abritent des espèces animales et végétales caractéristiques protégées au niveau national et/ou régional.